• pembimbingan
  • icon-pembimbingan-b
  • Pembimbingan Penelitian Mahasiswa oleh Puslit Bioteknologi LIPI
  • Pembimbingan Penelitian Mahasiswa oleh Puslit Bioteknologi LIPI

Desain dan Konstruksi RNAi untuk Knock-Down Ekspresi Gen Poligalakturonase pada Capsicum annuum : Skripsi

mekanisme RNAiCabai (Capsicum annuum) memiliki buah dengan kadar air tinggi. Buah cabai juga mempunyai sifat fisiologi yang cukup rentan terhadap kerusakan mekanis. Tanpa penanganan pascapanen yang tepat, industri buah cabai di Indonesia dapat mengalami kehilangan hasil panen hingga 40% akibat kerusakan pada saat transportasi dan penyimpanan. Kerusakan ini berhubungan dengan pelunakan buah setelah pematangan pascapanen. Pelunakan buah cabai disebabkan oleh degradasi komponen dinding sel secara enzimatis, yaitu pektin.

Poligalakturonase (PG) adalah enzim pendegradasi pektin utama dan memengaruhi perubahan tekstur buah tomat dan cabai secara signifikan. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain short-interfering RNA (siRNA) di dalam plasmid yang digunakan untuk konstruksi RNA interference (RNAi) dan menghambat ekspresi gen PG cabai dalam penelitian lebih lanjut. Sekuen siRNA berukuran 33 bp dari gen PG (C. annuum) diidentifikasi menggunakan aplikasi siDirect2 dan diintegrasikan pada desain insert berukuran 42 bp. Fragmen insert diligasi ke dalam sistem pTA2 dan diperbanyak melalui proses transformasi ke sistem Eschericia coli Top10. Konfirmasi keberhasilan integrasi insert ke dalam plasmid pTA2 dilakukan menggunakan PCR dengan sepasang primer yang berkomplemen dengan daerah upstream insert dan sekuen M13 reverse. Elektroforesis dari hasil PCR menunjukkan pita DNA berukuran 172 bp yang mengonfirmasi keberadaan insert di dalam plasmid. Analisis sekuensing telah mengonfirmasi bahwa insert yang terligasi memiliki ukuran dan susunan basa komplemen yang sesuai dengan desain sebelumnya. (Oleh Berbudi Bintang Pratama ; dibimbing oleh Dewi Yustika Sofia, M. si. dan Dr. Wahyuni, M. biomed.)

 

Pustakawan Ahmad Saefudin S

URL: http://perpus.biotek.lipi.go.id/index.php?p=fstream&fid=3491&bid=16098

Lock full review www.8betting.co.uk 888 Bookmaker

kunjungan

pelatihan

pembimbingan

pengujian

Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI